El Control Fiscal es una función pública mediante la cual se realiza una vigilancia de la forma como las entidades manejan los recursos públicos. Para tales fines, se hace uso de ciertos sistemas que permiten la valoración del manejo de dineros del Estado. Tal control debe ser desarrollado teniendo en cuenta principios tales como la eficiencia, economía, eficacia, equidad y valoración de costos ambientales; adicionalmente debe ser posterior y selectivo, es decir, la evaluación se realiza sobre procesos ya ejecutados sobre los cuales es posible hacer una valoración de resultados y se selecciona una muestra representativa de las operaciones adelantadas por la entidad, o empresa que maneja recursos del Estado.

Para tal fin se divide en control fiscal micro y control fiscal macro.

1. Control Fiscal Micro: Lo realizan las siguientes Contralorías Auxiliares: Central,  Descentralizada, Infraestructura Física, Cercofis Cali, Cercofis Palmira, Cercofis Tulúa, Cercofis Cartago.
2. Control Fiscal Macro: Lo realizan las siguientes Contralorías Auxiliares : 

• Recursos Naturales y Medio Ambiente 
• Financiera y Patrimonial.

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